两年的是技能型的，主要是为体育教学服务的，获得的是体育硕士学位。三年的是科研型的，主要是为科研服务，为读博等做基础，获得的是教育学硕士学位。这是专业方面，还有就是在学校中，待遇不一样。
一般来说，两年制的是专业硕士，三年制的是学术硕士~
具体不太清 你问问你要报考的体育院校吧 北京这边没听说过两年的研究生
