一般（绝大多数）组织档案跟随人事档案流转！但有特殊情况（极少数）单位不接受人事档案，却接受组织档案，或拒绝组织档案却接受人事档案。人事档案放到人事局或代理单位（就像你的情况），在单位不接受组织档案的情况下，可以把组织档案与人事档案放到一起。但建议你：把组织档案放到你的居住地（居委会或党支部），还有一种方法，放到你配偶所在单位也可以。
组织关系放到居住地，或户口所在地。
和档案一个地方
