我公司是小规模企业，增值税是查账征收，所得税是核定征收，增值税有最低的税款标准，不允许零申报

这个好像是当地税务局的土规定，我们也遇这样的问题。
我们的处理办法是这样的：先视同增值税预缴，等开到发票了，来冲抵前面未开票已缴税收入，同时计缴附加税（地税），但不能跨年，12月底，要看一看剩余的未开票已缴税收入有多少，一次性确认为无票收入，同时在申报12月税费时（次年1月申报），计算缴纳附加税（地税），如果年底不确认，就会存在记账收入和申报收入不一致。
估计你们的所得税应该是定率征收，一般是按照收入的6-10%作为所得额，再按25%核定征收。按照正常缴纳正常计提就可以了。

1.小规模纳税人如果财务健全能够建账，就没有核定跟查账。
2.增值税可以零申报，没有最低增值税标准这一说法，如果税务局要你交，也是预缴（防止偷税漏税）借：应交税金-增值税-销项 850
贷：银行存款 850
3.所得税核定征收
借：所得税
贷：银行存款
4.财务报表如何做：收入、成本、费用、税金，是多少就填多少，没有就填零

你这叫定额征收，多交税务当然不会反对的，增值税没有“查账征收”这说法的。其实你是不要提税的，在实际发生时，所得税做入“所得税”科目，增值税冲减收入，估计你平时的收入应该是含税的吧。 注：我回答的增值税的操作是不太规范的简便操作方法，正常应该提取增值税的。

采用双定征税的小规模纳税人
如果当期定额税款高于计提的应交增值税的，按差额部份记入营业外支出
借：营业外支出
贷：应交税金——应交增值税
你没有收入，所以你的帐务处理
借：营业外支出850
贷：应交税金——应交增值税850

双定主要是针对没有“账证（账本和凭证）”或虽有“账证”但很不规范，得不到税务部门认可的小企业和个体工商户，实施的一种征收税款模式。
本人个人认为你记错了也没事....
这个好像争议蛮大的。