1、遗传图谱的构建与重要农艺性状基因的标记通过建立分子遗传图谱,可同时对许多重要农艺性状基因进行标记.许多农作物上已构建了以分子标记为基础的遗传图谱. 2、近等基因系的培育与重要农艺性状基因的标记近等基因系的培育主要是通过多次的定向回交,它与原来的轮回亲本就构成了一对近等基因系.在回交导人目标性状基因的同时,与目标基因连锁的染色体片段将随之进入回交子代中.NIL作图的基本思路是鉴别位于导人的目标基因附近连锁区内的分子标记,借助于分子标记定位目标基因. 3、群体分离分析法与重要农艺性状基因的标记用某一作物的抗病品种与感病品种杂交,F2抗病基因发生分离.依抗病性表现将分离群体植株分为2组,1组为抗病,另1组为感病.然后分别从两组中选出5～10株抗、感极端类型的植株提取DNA,等量混合构成抗、感DNA池.对这两个混合DNA池进行多态性分析,筛选出有多态性差异的标记,再分析F2所有的分离单株,以验证该标记与目标性状基因的连锁关系以及连锁的紧密程度. 4、数量性状基因的定位同时用一个给定的染色体上的所有标记进行回归模型分析,利用加权最小平方和法或者模拟进行显著性测验.它具有计算速度快和在一个测验中利用所有标记信息的优点.如果一条染色体上只有一个QTL,所有定位和测定标记两侧之间的QTL效应的必要信息都可以利用.尽管你确实不知道哪些标记在QTL两侧或者每条染色体上只有一个QTL,不论QTL怎样在染色体上分布,多重标记方法确实提供了模型的整个测量结果.
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