最主线的就是在尾美一篇之后第三季的将军暗杀篇和再见真选组篇，天导众要除掉茂茂将军，真选组和万事屋和御庭番弄出真假将军分头行动，痔疮忍者也就是御庭番头领为了信念杀了茂茂将军，后经证实是为真茂茂将军脱身，事情败露后重伤并与银时真选组及另一个帮助将军的忍者村回合，激战中高杉晋助现身，与银时互相重伤后流露出对松阳时期怀念之感，不料被乌鸦八尺鸟从后偷袭，逃离后昏迷不醒，神威等也被追杀，然而将军却在抵达目的地后被儿时伙伴所杀，此役因真选组帮助将军近藤勋面临死刑，与不愿向新将军效忠的松平关在一起，真选组解散。桂小太郎为营救二人混入监狱，桂派与真选组联合和万事屋去监狱救人，与见回组火并，见回组组长佐佐木异三郎洗白并牺牲，剩下的人撤退后原真选组人去往各地宣传起义，后当初四攘夷志士聚在一起重新战斗，与骸手下四大将激战，为最终打到有松阳身躯的骸。纯手打望采纳
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