. —I haven’t seen you for ages. Haven’t you graduated from college?

— I haven’t seen you for ages. Haven’t you graduated from college?
好久不见了。你大学毕业了吗？
— Yes. I _____ English for four years in Nanjing.
是的，我在南京学习了四年英语。
显然这是说，我已经毕业了，因为我已经学习满四年英语了，所以学四年英语应该是说的过去的事情
如果用B，则说明他就在学习中，尚未毕业才这样用，我已经学了四年英语，可是没过关，有课程不及格，所以还没毕业，这时才用have studied，但前面就不能说已经毕业了

开你个小玩笑，你这个太不厚道，让人家毕业，又让人继续学习，看来是学无止境啊

这个就是语感问题了。你翻译一下试试：
B：我已经在南京学了四年英语
D：我在南京学了四年英语
回答只是在讲述自己的事，没必要用完成时。用完成时的话会暗含已经经过一段时间，还将继续的意思。但是回答者说已经毕业了，当然也就不会再继续下去，用B就颇为牵强。
而用D的过去式只是在讲述事实，已经发生过的事，有一点随意但是并无问题
这种问题更多的还是需要语感，英语用多了就好了
希望对你有帮助~

先译成中文：
----我有几年都没见到你了。你已经从大学毕业了吗？
----是的。我（过去）曾在南京学了4年英语（现已毕业）。
这样来看，因为后者回答是yes，要前后文匹配，只有用一般过去时studied
才能体现 现已从大学毕业的含义 ，而不是现在完成时have studied 所表达的
我已经在南京读了四年大学。