按照相关规定，年底取得年薪奖金，将取得全年一次性奖金，单独作为一个月工资、薪金所得计算纳税；将当月内取得的全年一次性奖金，除以12个月，按其商数确定适用税率和速算扣除数。
当月应纳税=当月取得全年一次性奖金（年薪制年终奖）×适用税率速算扣除数。实行年薪制经理当月取得年薪奖金所缴税加上平时预发工资预缴个人所得税就是年薪制经理全年所缴税。
例如，某企业部门经理王某所在单位实行年薪制，企业每月发给王经理2000元基本收入（已扣除养老保险金、基本医疗保险金、失业保险金、住房公积金）；根据绩效考核年底取得年薪奖金48000元。则王经理平均每月缴个人所得税为：（20001200）×10%%25=55（元）。根据个人取得全年一性奖金计算征收个人所得税的办法计算规定，王经理年终取得年薪制奖金48000元，除以12为4000元，其对应的税率为15%%、速算扣除为125元，则王经理年终奖应纳个人所得税=48000×15%%125=7075（元）。王经理全年应纳税=55×127075=7735（元）。
南京地税征收分局相关人员介绍说，个人取得全年一次性奖金等计算征收个人所得税新办法实行后，按新办法计算与过去对比，年薪制或者绩效工资制税负略有增加。税负略有增加的原因，主要是在于速算扣除数扣除次数不同。原办法是把平时工资和年终奖相加后除以12个月得出每个月的平均数，按对应的税率和速算扣除数算出一个月应缴纳的个人所得税，然后乘以12月得出全年的个人所得税；新办法将年终奖除以12个月平均后确定适用税率和速算扣除数，再加上平时每月预发工资所预缴的税，即得出年薪制所缴税。（树华鲍平晓风）缴税新旧方法对比2004年12月31日以前个人取得全年一次性奖金计征个人所得税的计算方法:月收入预缴税（2000-1200）×10%-25=55（元）当月取得年终奖缴税1、取得年终奖与当月收入合并，计算平均每月收入（48000+2000×12）÷12=6000（元）2、每月缴税（6000-1200）×15%-125=595（元）3、当月缴税595×12-55×12=6480（元）全年缴税全年缴税=595×12=7140（元）2005年1月1日后个人取得全年一次性奖金等计征个人所得税的计算方法:月收入预缴税（2000-1200）×10%-25=55（元）当月取得年终奖缴税1、找适用税率、速算扣除数48000÷12=40004000对应的税率15、速算扣除数1252、取得年终奖当月缴税48000×15%-125=7075（元）全年缴税全年缴税=55×12+7075=7735（元）相差：7735-7140=595（元）
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