1、表示的财务报表质量不同：
标准审计报告表明会计师认为财务报表质量合格；而非标准意见审计报告表示会计师认为财务报表质量不合格。
2、报告要求不同：
凡注册会计师对上市公司的财务报告出具非标准无保留审计意见的，应根据独立审计准则要求，清楚地说明出具该意见的原因及依据，并对该意见涉及事项对上市公司财务报告的影响做出估计，无法估计的应当说明原因。
3、对保留意见的要求不同：
标准审计报告包含的审计报告要素齐全，属于无保留意见，且不附加说明段、强调事项段或任何修饰性用语，否则不能称为标准审计报告。非标准审计报告是指带强调事项段或其他事项段的审计报告和非无保留意见的审计报告。非无保留意见是指保留意见、否定意见或无法表示意见。
参考资料来源：百度百科-标准审计报告
参考资料来源：百度百科-非标准审计报告
1、功能不同
标准审计报告是指不含有说明段、强调事项段、其他事项段或其他任何修饰性用语的无保留意见的审计报告。无保留意见是指当注册会计师认为财务报表在所有重大方面按照适用的财务报告编制基础编制并实现公允反映时发表的审计意见。
非标准审计报告是指带强调事项段或其他事项段的审计报告和非无保留意见的审计报告。非无保留意见是指保留意见、否定意见或无法表示意见。
2、报告形式不同
当注册会计师出具的无保留意见的审计报告不附加说明段、强调事项段或任何修饰性用语时，该报告称为标准审计报告。标准审计报告包含的审计报告要素齐全，属于无保留意见，且不附加说明段、强调事项段或任何修饰性用语，否则不能称为标准审计报告。
非标意见通常以4种形式出现，带强调事项段的无保留意见、保留意见、否定意见和无法表示意见。
3、特点不同
标准审计报告中财务报表已经按照使用的会计准则和相关会计制度的规定编制，在所有重大方面公允反映了被审计单位的财务状况、经营成果和现金流量。
凡注册会计师对上市公司的财务报告出具非标准无保留审计意见的，应根据独立审计准则要求，清楚地说明出具该意见的原因及依据，并对该意见涉及事项对上市公司财务报告的影响做出估计，无法估计的应当说明原因。
参考资料来源：百度百科-非标准审计报告
参考资料来源：百度百科-标准审计报告
(一)标准审计报告
如果认为财务报表在所有重大方面按照适用的财务报告编制基础编制并实现公允反映，注册会计师应当发表无保留意见。
当出具无保留意见的审计报告时，注册会计师应当以“我们认为”作为意见段的开头，并使用“在所有重大方面”、“公允反映”等术语。
(二)非标准审计报告
非标准审计报告，是指标带强调事项段或其他事项段的无保留意见的审计报告和非无保留意见的审计报告。
1.带强调事项段或其他事项段的无保留意见的审计报告
强调事项段，是指审计报告中含有的一个段落，该段落提及已在财务报表中恰当列报或披露的事项，根据注册会计师的职业判断，该事项对财务报表使用者理解财务报表至关重要。
加强调事项段的情形举例如下：
（1）异常诉讼或监管行动的未来结果存在不确定性。
（2）提前应用(在允许的情况下)对财务报表有广泛影响的新会计准则。
（3）存在已经或持续对被审计单位财务状况产生重大影响的特大灾难。
如果在审计报告中增加强调事项段时注册会计师采取的措施：
（1）将强调事项段紧接在审计意见段之后；
（2）使用“强调事项”或其他适当标题；
（3）明确提及被强调事项以及相关披露的位置，以便能够在财务报表中找到对该事项的详细描述；
（4）指出审计意见没有因该强调事项而改变。
其他事项段，是指审计报告中含有的一个段落，该段落提及未在财务报表中列报或披露的事项，根据注册会计师的职业判断，该事项与财务报表使用者理解审计工作、注册会计师责任或审计报告相关。
2.非无保留意见的审计报告
非无保留意见是指保留意见、否定意见或无法表示意见。
第一，根据获取的审计证据，得出财务报表整体存在重大错报的结论。
第二，无法获取充分、适当的审计证据，不能得出财务报表整体不存在重大错报的结论。
(1)保留意见
(2)否定意见
(3)无法表示意见
标准审计报告指无保留意见的审计报告。非标准包括无保留意见加强调事项段报告和保留意见报告，保留意见报告包括否定意见报告、无法表示意见报告
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