100分求救~~pci-e2.0显卡插在PCI-E X16插槽 运行时在X2的工作下~~~

额，我觉得最好的办法就是在你身边找个电脑小神童之类的帮手。让他帮你看看，个人认为最大可能是主板bios设置。
================================
①你试试看把主板bios读取默认设置，再重启电脑用GPU-Z再看看。
②如果你觉得必要，可以上www.biostar.cn =》 技术支持 =》下载，更新主板bios。来获得对最新显卡的支持。蛋是，我查了你那款，貌似没发现bios的针对显卡的更新。
③还有我要提醒的是不是最新的显卡驱动就是好驱动（最适合的驱动），我建议你下6850和6870发布的前一个月的那款驱动（就是催化剂10.9），之后的驱动都是为6xxx而写，这款应该最稳定。盲目追新驱动也没多大意义。
④也建议你在bios中，试试看把板载图形芯片禁用，并在VGA设备选择顺序中，把独立显卡的放在第一位。
======================================
(以前的回答)
楼主你可能是瞎担心了。

这个是显卡运行在节电模式，我没有5XXX的显卡，只有一张可怜的4670。根据我的经验，我的显卡在桌面，运行办公软件等不需要太多显卡资源的情况下 运行在PCI-E @1.1 X16模式下，我查了查1.1和2.0区别。1.1 比2.0省电不少，在线路（金手指那部分，应该还包括其他的地方的线路，这个我不是很清楚）的传输频率上是2.0的一半，在同等电压下节约一半的电。当然也算变相的延长显卡的寿命啦。

我的主板是Intel P43 可能和你的AMD 790G的节能方式不同。
你的 X2 我觉得也是同样的道理。

最好的办法就是弄个3D游戏，窗口化玩，再打开GPU-Z，再看看是不是参数都正常了。
其实我也为这个问题纠结过，最后无意中发现在显卡硬解高清电影时候GPU-Z显示就正常了，我又试了试3D游戏窗口化，也回到了 @2.0 X16 ，我很开心，显卡还有这种功能。要不然多费电啊。

可能性挺多啊，这款主板是不是支持双卡的？多数都是2条x16的插槽，但是也有一些只有一条是，你可以换一口插上试一试。
查了一下主板型号，集成显卡的主板需要在bios中屏蔽集成显卡，而不是让它自动切换独立显卡。

你就用过gpuz这一个吗？检测错误咋办？！

兄弟，劝你一句，显卡驱动别用最新的，找微软验证的并且是早一点的显卡驱动！

你找主板说明书，看是不是有哪个跳线限制了