RNA分子有很多二级结构，需经变性剂处理，而DNA一般不需要变性处理RNA电泳的电泳槽及缓冲液均需要确保无RNAase，有RNAase抑制剂处理过；而DNA相应的则需要DNAase抑制剂处理所用的缓冲液不同染色过程不同
RNA分子有很多二级结构，需经变性剂处理，可以破坏RNA中的二级结构。然后，用琼脂糖凝胶电泳可分级分离不同大小的mRNA分子。
RNA有二级结构，跑前应先加变性剂，并先跑下空胶。DNA都不用
