（1）省级行政中心A是广东省的广州市．（2）特别行政区B是香港，邻近的经济特区C是深圳，香港位于珠江口东侧．（3）铁路D是京九线，起止点城市是北京和香港的九龙．（4）海域E是南海．故答案为：（1）广州；（2）香港；深圳；（3）京九；（4）南．
