苯甲酸钠与苯甲酸液相色谱的差异很大。苯甲酸钠是一个有机盐， 离子性质强烈， 会被液相色谱的色谱柱吸附，而无法流出。苯甲酸本身也有很强的极性， 吸附能力也比较强， 一般都是用对应的苯甲酸酯来检测。苯甲酸本身要用强的极性溶剂如乙醇和正己烷的混合溶剂来做流动相。需要说明的是苯甲酸钠与苯甲酸对色谱柱都有损害。因为这些物质被吸附后， 很难流出， 使得色谱柱的分离效率降低甚至失效。
