根据携程上的数据，只有一趟。
国内机场大巴最晚一般在23:00，过了午夜就只能打的了。
参考资料
昆明机场信息查询,昆明航空公司状况【携程攻略】.携程[引用时间2018-3-9]
晚上有空港1和2号线一直运营到当天的航班结束。
空港1号线：
回程：西驿酒店（小西门原新南疆宾馆）→新迎小区（人民东路）→昆明长水国际机场。
时间：5时到23时
去程：昆明长水国际机场→新迎小区（人民东路）→昆明雄业大酒店（北京路）→西驿酒
店（小西门原新南疆宾馆）。
时间：8时到凌晨2时
空港1号线每20分钟发一班车。票价25元。
空港2号线（单向车程大约55分钟）
回程：巫家坝→锦江大酒店（昆明火车站）→佳路达酒店（环城南路）→新迎小区（人民东路）→昆明长水国际机场。
时间：5时到23时
去程：昆明长水国际机场→新迎小区（人民东路）→泰丽酒店（环城南路）→锦江大酒店（昆明火车站）→巫家坝。
时间：首班8时，末班车一直到当天航班结束。
空港2号线每20分钟发一班车。票价25元。
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