核定征收和 查账征收是针对企业所得税。增值税没有核定征收和 查账征收之分类。增值税有小规模纳税人企业和一般纳税人企业之分，小规模纳税人可以开增值税普通发票，一般纳税人可以开增值税专用发票，也可以开增值税普通发票。
核定征收和查账征收是针对的是餐饮、服务业缴纳流转环节的营业税、增值税。
对于个体、私营小规模的餐饮、服务业，账务不健全，采用核定征收。对于经营规模较大、账务比较健全的餐饮、服务业采用查账征收。
企业所得税，增值税没有
您公司要交所得税、增值税、城建税、教育费、印花税、车船使用税、如果涉及营业税业务的话，还要交营业税。若您公司不想成为一般纳税人或账目不全的话，可以申请定率征收。
查帐征收指所得税按照会计报表和明细帐征收。
定率征收指所得税按照税务给您定的征收率X收入征收。
您公司应该交100*4%=4万的增值税
PS: 如果您公司营业收入比较多的话，还是建议查帐征收，这样可以用成本和费用减少利润，少交所得税，如果一定要申请定率征收的话，要跟税务搞好关系，让他们把征税率作低些。
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