云南省中医医院是全国建设历史较长的省级中医医院之一，为大型综合性三级甲等中医医院，是云南省和昆明市城镇职工和城镇居民的医疗保险的定点医疗机构和医疗保险转诊的定点医疗机构，从2009年1月起，成为全云南省新农合定点医疗机构之一。
