①恩格尔曼采用水绵、好氧细菌和极细光束进行对照实验，发现光合作用的场所是叶绿体，他的实验过程并没有采用同位素标记法，①错误；
②梅耶根据能量转换与守恒定律明确指出植物进行光合作用时光能转换为化学能，他未采用同位素标记法，②错误；
③鲁宾和卡门采用同位素标记法进行实验证明光合作用释放的O2来自水，③正确；
④卡尔文采用同位素标记法探明了CO2的固定过程中碳元素的转移途径，④正确；
⑤用3H标记氨基酸，通过检测放射性，可以探明分泌蛋白的合成与运输过程，从而证明细胞器之间的协调配合，⑤正确．
故选：D
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