理论上说，无论甲亢或甲低，病情轻者均不影响怀孕，但其流产或死胎率较高。因此，专家建议有甲状腺疾病的患者在治疗甲状腺疾病的初期，应先做好生育控制，以避免服用大量抗甲状腺药物时受孕，造成对胎儿的影响。至于重度或久治不愈的甲状腺机能亢进病人，则不宜怀孕，一旦怀孕，应做人工流产。甲亢病人如妊娠，应列为高危妊娠，于妊娠全过程中应在产科及内分泌科共同监护下度过孕产期。
和甲亢相比，甲减的症状比较隐匿，容易被患者忽视而耽误了治疗。通常，初期的甲减常表现为精神不振、贪睡、记忆力下降、不明原因的浮肿或是体重增加，当出现这些症状时就需要警惕了。如果甲减没有得到及时治疗，危害会进一步增加，除了会引起不孕之外，还可能造成心率降低、血脂紊乱、便秘乃至心脏、肾脏等器官出现问题。与此同时，甲减病人在病情没有完全控制好之前，也是不宜怀孕的。“因为甲状腺激素与胎儿大脑发育有着密切的关系。胎儿在发育初期需要由母体供给甲状腺激素，甲减的女性由于甲状腺功能低下，本身的甲状腺激素就少，更别说提供给胎儿了。而胎儿一旦缺乏甲状腺素，智力会受到严重影响，而且还可能会出现呆小症。”
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