深加工结转报关，申报完进口，出口不报了可以吗？如果不可以，会有什么后果

最好是要申报出口或把进口报关单删单 否则 风险极高。
因为海关系统需要对两个报关单进行关联
只有进没有出 无法关联 要是被海关发现 海关会找你们 删除进口或申报出口就没问题 如果不能删进口或报出口 那就得补税了 不过问题一般不大，不会罚款。
如果你们进口手册可以核销 付汇也没问题 财务没问题 那就可以不管。手册一核销就完事大吉了。
在实际的工作中 我还真遇到过你这样的情况 后来也就那样了 没事。

那是针对电子关封的吧？我不是南头海关的，但我经常和南头海关那边做结转，不需要关封的很简单：进口方报进口（委托报关行）-传真进口报关单给出口方-出口方报出口（委托报关行申报）。
需要关封的有两类情形，纸质关封和电子关封。纸质关封的是针对跨关区来说：出口方先向海关申请出口备案，也就是做纸质关封-做好后寄给进口方做进口备案-进口方做好备案后也就是纸质关封出来后委托报关行报进口-传真给出口方报出口。电子关封（海关新规，无论同关区还是跨关区，做的话必须双方都做，跨关区必须要有纸质或电子关封才能进行报关）：出口方预录入出口《结转申请表》-进口方录入《结转申请表》-出口方录入发货单-进口方录入收货单-进口方报关-出口方报关。由于电子关封需要海关审批的，所以海关当然要有专门的窗口做这个工作。注：关封也就是《结转申请表》。