贵州石漠化严重既有自然原因,也有人为原因,其自然原因有:大部分地区土层较薄,植被根系浅;该地属亚热带季风气候;降水集中于夏季;贵州境内石灰岩分布广泛;其人为原因有:不合理的开垦活动破坏了原有植被,造成严重的水土流失,加速了石漠化的进程;因此,①②③属于自然原因;④⑤属于人为原因;根据题意,故选:A.