探测表明，木星大气中的成分与地球不同，氢占82%，氦占17%，其余是甲烷、氨等气体。探测器观测到有氨云及很薄的硫酸氢氨云存在，这和科学家的预计一致；但预计木星上也应有水云存在，而观测却没有找到证据，这表明木星大气中水的丰度比预料的低。探测器所探测的区域大气十分干燥，但整个木星是否都如此，还有待证明。探测器在对木星大气进行实地探测过程中，还遭遇到强烈的狂风和湍流，在云层深处161千米，风速达150米/秒。探测器的雷电探测装置还发现了个别的但比地球上的雷电强10倍的木星雷电。
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