公司各部门私定制度随意扣员工工资是不对的。首先公司应制定一个《员工手册》，在这个里面明确员工的行为标准、工作标准等，明确哪些事是鼓励员工做的，并且怎么奖励；还要界定哪些是禁止员工做的，违规了要处罚。《员工手册》的出台要通过征集员工意见、反复修订确认后，最后通过总经理审批正式发文，并且要公布张贴，还需对员工进行《员工手册》的培训，再开始试行，这样就有了企业的基本法。然后各部门可根据《员工手册》这个基本法及部门实际工作制定一些奖罚细则，奖罚细则同样要经过意见征集、修订、分管领导审核，最后总经理审批，制度出台流程都是一个严格的过程，不应该是哪个部门说了算的事情。
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