中西医结合消化科为省重点专科建设单位,现有省名中医2名,市名中医2名,主任医师5名,副主任医师2名,博士生1名,硕士生2名。该科以科技创新为动力,以科学管理为手段,积极实施精中汇西战略,开展对慢性胃病、消化性溃疡、慢性肠炎、各种肝病等疾病的治疗。中医妇科为镇江市重点专科。运用中医、中西医结合治疗卵巢肿瘤、急慢性盆腔炎、附件囊肿、先兆流产等妇科常见病有很好的疗效,同时开展子宫肌瘤、卵巢肿瘤等各类西医手术。脑血管病专科为镇江市重点专科。融中西药物、针灸、康复治疗于一体,在中风(脑血管病)、面瘫、中枢神经系统感染,老年性痴呆,眩晕、头痛等疾病的治疗上充分发挥中医药优势,形成了自己独特的诊疗规范。2004年市急救中心在中医院设立了全市第一家急救分站,急诊科设有急诊内科、外科、骨伤科、小儿科、妇科等相关科室,具有较强的抢救技术队伍和先进的抢救设备。外科能熟练开展胸外、普外、脑外、泌尿等外科手术;尤其是近几年微创外科有了快速的发展,加之采用中医中药手段,其病程短、痛苦少、费用低的优势,取得了良好的社会效果。骨伤科能运用中、西两法处理四肢骨折,开展人工关节置换、颈胸腰脊椎等手术。肛肠科源于省内外闻名的“丁氏痔科”,博采中西医众家之长,将中医传统疗法与西医手术方法完美结合,并且与全国肛肠医疗中心合作成立全国肛肠医疗中心镇江技术协作中心,科室得到了跨越发展。