不是影响的问题，既然你买了房，你母亲就没有了申请经适房的条件了吧。
你母亲的房产几个平方？此房产中户口上除了你，你儿子和你母亲还有其他人吗？如果只有一个人，那么这套房产只要不超过15个平方，你母亲还是可以申请看看的。不过只能申请一室户，另外，你母亲有还款能力吗？你将不能做共同申请人，所以不能帮她还贷款的。
户口不需要迁出去，只要去街道填一张放弃参与面积审核的单子，签字，你那套房子就不会影响你母亲的申请了，但是你和你儿子也不能平摊面积了。
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