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1、根据《刑法》第384条规定，挪用公款罪是指国家工作人员利用职务上的便利，挪用公款归个人使用，进行非法活动的，或者挪用公款数额较大、进行营利活动的，或者挪用公款数额较大、超过三个月未还的行为。实际上，《刑法》第185条第2款、第272条第2款的规定也是对挪用公款罪的立法。挪用公款罪是挪用型国家工作人员职务犯罪，其演变于贪污罪，该罪在我国古代由来已久。在国外立法中，绝大多数国家把挪用公款罪作为贪污罪来追究。例如《意大利刑法典》第314条第2款规定的贪污行为实际上是挪用公款行为，该条文规定“犯罪人仅以暂时使用物品为目的，并且在暂时使用后立即予以归还时，适用6个月至3年有期徒刑。”
2、你舅舅的行为已经构成犯罪，根据“先刑事后民事”的原则，刑事案件终结后，才能解决民事赔。
3、你舅舅到药厂工作，你用房产担保，不符合法律规定，不受法律保护。你舅舅犯罪所得与你的民事担保不是一个法律关系。不能混为一谈。

如果我没理解错的话,你是希望能免除你的担保责任.
那么,我觉得你应该把你的担保合同讲详细点,大家帮你出出主意,也是可以的.
首先,你担保的标的是什么?这必须搞清楚.我想你再糊涂,也不会说担保你舅舅犯不犯罪.而且这种担保根本就没有法律依据,就象楼上的赵红文律师所言,如果担保不符合法律规定,不受法律保护,你当然就可以免除担保责任了.
其次,你也不用担心是否法院会拍卖你的房子.因为这是你的唯一住房，所以法院判决该房屋冻结，你只要不出售该房屋或者购买其他房屋.你如果有理由,可以对法院的冻结判决提出申诉(估计已过上诉期,判决已经生效);如果找不到理由,就维持现状.冤有头,债有主,你舅舅的钱还是等他出来以后自己还.
最后,如果真想解决问题,还是带齐资料,到律师事务所找律师咨询一下,咨询一般是免费的.

以当时对你舅舅的判决为准,就是说三年零八个月为限.你舅舅要还上他所欠的公款,如果你舅舅还不出.或者不够,就要拍卖你的房子了.

要看担保合同的具体约定了,建议您找当地的律师帮助.

执行民事判决,查封只是限制你买卖,但不影响你使用。