你好，这个问题需要你们自己去协商讨论了，因为你的女儿并没有和他离婚，那只有离婚了，我觉得他才会根据协议的要求搬走吧。
你女婿住着丈母娘的房子赖着不走。你女儿已经和他分居三年。那你叫女儿给他办离婚手续吧，离婚了你女婿不走，你可以起诉他。叫他离开的。你女儿如果不办离婚手续，你是没有办法赶他走的。
先可以用司法部门来调解，调解不好，通过法律手段。别心慈手软，对付这样无赖只有法律来解决。
像这样的无赖只能走法律手段了，因为私下已经解决不了了，建议你去法院立案解决此事情。
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