有限公司的股东与法人代表之间有矛盾的话如果处理?

看来您目前还没有注册，对吗？
根据《公司法》，你们只有两名股东，那么股东会就只有你们两个人。至于董事会因为股东人数少，可以不设立，指定一名执行董事即可，一般该执行董事即为公司的法人代表。法人代表只是一个称呼，没有任何职权。执行董事才有相应的职权，而这个职权也是行政上的职权。对于资产和重要决定的处理权法律规定属于所有股东，即股东会，而在股东会理，持股超过所有股份三分之二的大股东有绝对说一不二的权力效果，而持股超过二分之一的大股东基本上是说了算的。法律规定就是这样。

实际操作：
1. 虽然“法人代表”只是一个称呼，但是社会上一般认为法人代表是老板，是核心，你要有心理准备阿！

2. 虽然《公司法》的规定强制性保证了你这个大股东的利益和话语权，但是，你们毕竟是一起合伙做事情，真要有意见不和的时候，你动不动就拿《公司法》来压他，他也未必服你，根本不能解决问题。

3. 给您一个建议：《公司法》新规定，一个人可以注册成立有限公司了，不一定要两个以上的股东，一个股东也可以。建议您自己注册。如果需要他的帮助，可以聘请他为你做事。

4. 你们二人成立的有限公司，如果其中一人想撤资不干了，根据《公司法》的规定，应该把股份转让出来，另一人具有优先购买权。

如一楼所说，建议您学习一下《公司法》。搞企业应该要明白这个才好。

股东的权益通过董事会、股东会的机制来保证。
建议学学《公司法》！

公司最高权力机构:股东会
股东会即由全体出资人组成,股东会中已股权持有多少来行使表决权和分配权.
A股东会有以下职权：
（一） 决定公司的经营方针和投资计划；
（二） 选举和更换执行董事，决定有关执行董事的报酬事项；
（三） 选举和更换由职工代表出任的监事，决定有关监事的报酬事项；
（四） 审议批准执行董事的报告或监事的报告；
（五） 审议批准公司年度财务预、决算方按以及利润分配、弥补亏损方案；
（六） 对公司增加或减少注册资本作出决议；
（七） 对公司的分立、合并、清算或者变更公司形式作出决议；
（八） 修改公司的章程；
（九） 聘任或解聘公司的经理；
（十） 对发行公司债券作出决议；
（十一） 公司章程规定的其他职权。
B股东的权利：
（一） 出席股东会，并根据其出资比例享有表决权；
（二） 股东有权查阅股东会会议记录和公司财务会计报告；
（三） 选举和被选举为公司执行董事或监事；
（四） 股东按出资比例分取红利。公司新增资本时，股东可按出资比例优先认缴出资；
（五） 公司新增资本金或其他股东转让股份时有优先认购权；
（六） 公司终止后，依法分取公司剩余财产。

法定代表人也是通过股东会选举出来的.而且法定代表人是对公司负法律责任的人,权力如下:
（一） 负责召集股东会，并向股东会报告工作；
（二） 执行股东会的决议，制定实施细则；
（三） 决定公司的经营计划和投资方案；
（四） 制订公司年度财务预、决算，利润分配、弥补亏损方案；
（五） 制订公司增加和减少注册资本、分立、变更公司形式，解散、设立分公司的方案；
（六） 决定公司内部管理机构的设置和公司经理人选及报酬事项；
（七） 根据经理的提名，聘任或者解聘公司副经理、财务负责人，决定其报酬事项；
（八） 制定公司的基本管理制度。