A、制作不同的发酵食品，所利用的真菌或细菌是不同的种类，如制作腐乳、酸奶等要用到乳酸菌，酿酒要用到酵母菌，制醋要用到醋酸菌，A正确；
B、夏天温度较高，食物中的细菌、真菌繁殖加快，食物中细菌真菌数量大量增加繁殖，进而分解食品中的有机物，导致食品的腐败变质，B正确；
C、有的真菌能引起多种疾病，有的真菌却可以产生杀死某些致病细菌的物质，这些物质被称为抗生素，抗生素可以用来治疗相应的疾病．如青霉素，如果滥用会引起细菌的抗药性增强，还会杀死人体内有益的细菌，C错误；
D、细菌的分裂生殖和真菌的孢子生殖都是无性生殖，D正确．
故选：C．
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