农业银行房贷卡余额不足逾期1天，于第二天存入，会有什么影响？

您问的是两个问题，根据缓急先回复您第二个问题：
您已经存入农业银行还房贷的银行卡，会不会自动扣款，要看您当初银行卡的扣款设置，有没有设置成自动扣款。如果当初设置成自动扣款，那就会的，如果没有设置为自动扣款，那您需要马上到农行柜台办理扣款业务。
第一个问题：余额不足逾期1天存入，不会有影响，每家银行贷款还款都有最迟还款日，只要在最迟还款日之前还上，就没问题，可以放心。
建议：如果已经设置成自动扣款是最好，如果没有，还是去银行设置成自动扣款，这样比较省心。另外：到农业银行给还房贷的银行卡办理一个短信提示业务，每个月还款成功都会收到短信提示，扣款不成功也会有短信提示，不仅方便，还可以避免出现扣款不成功，您不知情而出现的逾期被动。

目前，全行理财、贷款、代付等各类批量业务均在日终结算后一定时间区间内执行，具体时间并不固定，在实际执行过程中，系统将在约定日内完成扣款，具体以实际扣款时间为准，建议您在约定日17:00前确保还款金额到账。
还款日扣款失败之后，系统会于次日及次日以后日终时继续再扣，有多少扣多少（有的分行有扣款最小额，如500元），直到把逾期期次的欠款扣完为止。
温馨提示：
个人住房公积金贷款的逾期扣款规则各地不一致，请咨询当地贷款行。