只要不违反法律与公序良俗的协议都是有效的，如果对方认可并履行是有效的。但要是对方不履行或提出异议时，可以不会受到法律支持。
我国婚姻法规定的结婚自愿，离婚自由，只要具备了离婚的条件即可以离婚。仅约定离婚要赔偿，没有法律依据，且限制了对方的婚姻自主权，法院不会支持的。
对于离婚，男方通过协议方式愿意补偿女方50万元的，只要协议内容符合法律规定，当事人在自愿合法前提下签订协议的，协议具有法律效力，当事人都应当遵守协议约定。具体情况，请当事人自行根据实际情况及相关法律规定进行核实确定。
相关法律规定：《中华人民共和国合同法》
第四十四条 依法成立的合同，自成立时生效。
法律、行政法规规定应当办理批准、登记等手续生效的，依照其规定。
第四十五条 当事人对合同的效力可以约定附条件。附生效条件的合同，自条件成就时生效。附解除条件的合同，自条件成就时失效。
当事人为自己的利益不正当地阻止条件成就的，视为条件已成就；不正当地促成条件成就的，视为条件不成就。
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