A、隔离是新物种形成的必要条件，必须有生殖隔离，A错误；B、自然选择决定生物进化的方向，基因突变的方向是不定向的，B错误；C、生物进化的实质是种群基因频率的改变，C错误；D、不同物种间、生物与无机环境之间在相互影响中不断进化和发展，这就是共同进化，D正确．故选：D
