如何将linux blast的结果作为下一轮blast的数据库使用

2024-12-18 14:32:37
推荐回答(2个)
回答1:

1. 开通服务器帐号;
2. 安装两个软件 winscp和putty.
3. 用winscp登录,如下图
4. 登陆上去,如下图:左面是你的电脑,右面是服务器
现将BLAST的压缩包上传,并解压缩(命令:tar zxvf blast2.2.20.tar.gz)
进入blast/bin目录(命令:cd blast/bin)

将要查询的fasta格式序列(比如:unigene数据),和数据库文件(比如:基因组数据)上传到服务器上,从左向右拖拽即可。(注意:查询文件和数据库文件都要求是fasta格式)
5.点击下图位置进入putty,
输入用户名密码后,就到了用户名当前目录下,利用cd进入到bin目录下
如果不知道自己在哪,可以敲ls,查看当前目录下的文件。具体参考linux常见shell命令
6. 敲ls,确定刚才上传的两个文件,(比如unigene.fa和genome.fa)在当前目录下。
7. 两个命令完成blast:

回答2:

现将BLAST的压缩包上传,并解压缩(命令:tar zxvf blast2.2.20.tar.gz)
进入blast/bin目录(命令:cd blast/bin)

将要查询的fasta格式序列(比如:unigene数据),和数据库文件(比如:基因组数据)上传到服务器上,从左向右拖拽即可。(注意:查询文件和数据库文件都要求是fasta格式)