营改增后对企业财务主要有以下几方面的影响：
税负影响
从税负角度分析，营改增对于小规模企业纳税人及一般纳税人来说，作用较为明显。营改增可有效降低小规模企业的税负率，并增加了现代服务业的可抵扣税额的数额和范围，提高了运输支出抵扣税额比例。从行业的角度分析，营改增增加了交通运输业的可抵扣税负，将税率从原来的3%提高至11%，但由于税负波动幅度较小，在实际征收过程中，部分企业的税负下降幅度不大。对于一些非可抵扣类资产行业及劳务行业来说，税负差异性较大，部分企业税负并无下降，反呈上升趋势。
会计核算影响
营改增对企业会计核算的影响较大，营业税征收时，并不存在销项税额以及进项税额，相关收入只需按实际入账即可，而成本按照实际支出为准。但实行营改增后，彻底改变了收入入账方式和原则。从会计核算的角度分析，营改增后，税金、成本以及相关收入方面的核算方式发生巨大变化，企业财务管理也随着核算方式的改变而改变。营改增试点企业与非试点企业的会计核算方式不一致，由于营改增并未实行一次性推广，只在部分地区试点，因此，加大了部分跨地区经营企业的会计核算难度。这部分跨地区经营企业需进行不同税种的调整，对不同的税收方式进行衔接，企业会计的核算难度较大。营改增对于综合经营企业来说，在企业会计核算方面的要求更高，如果在营改增过程中，如果综合经营企业无法划分出明确的经营业务性质，无法将各类业务的核算明细化，则按照高税率税种来进行企业的会计核算。
发票管理影响
营改增对于发票的管理也造成了一定的影响。例如，在征收营业税时，服务类企业发票只需开具税务发票，但实行营改增税制后，由于分有销项税、进项税，企业发票的管理更加规范更加严格。增值税发票管理存在小规模纳税人及一般纳税人之分，小规模纳税人所用的发票只有一种，即普通发票，在发票管理方面，与营业税发票管理相似。一般纳税人的发票分为2种，即普通发票和专用发票，税务部对于发票的使用也提出了明确规定。由于增值税关系到税收的抵扣，如发票使用不当将会造成企业的法律风险。增值发票的限额较低，与营业税发票限额不一样，增值税一般纳税人的发票限额一般为10万元，与服务业务限额存在较大差距。申请高额发票时，所需时间长，不利于业务的开展。
从行业上分析现代服务业相对受益比较明显，大部分小规模企业已经一般纳税人企业可以正常取得进项税票的企业税负基本都有了不同程度的降低，致使企业收益有不同程度的增加。
而交通运输业的一些企业可能有税负增加的，因为税率为11%，而可以抵扣的部分又不能完全取得增值税专用票用以抵扣(比如支付给非试点地区的一些费用，加油等)，从而导致税负增加
再有一些可以实行差额征税的企业，他们的一些费用支出只能是针对支付给非试点纳税人，而支付给试点纳税人的部分款项是不允许扣除的，所以导致一些企业税负增加了。
税负的增加也使企业减少了收益，有些对于税负增加的部分驾驭到客户身上，从而使一部分企业加大了成本，减少了收益。
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