鉴于你提供的情况，以自己多年的临床经验分析如下供参考：
首先宝宝的当科医生的诊断是正确的。
诊断依据：高热、强直、抽搐及脑脊液检验的阳性结果，结合其他临床的阳性体征如克尼格征及布鲁金斯基征阳性是完全可以确诊的。
关于治疗中的临床症状消失唯有脑脊液阳性结果不降反升，临床上我们也遇到类似患儿，纠其原因，是由于各种病毒引起的急性病毒性脑炎差异较大，决定于①神经系统受累的部位；②病毒致病的强度；③患儿的免疫反应等。当然也不排除病毒耐药的可能及临床治疗措施是否得当等等。
当然也没有一个统一的出院标准，一般我们临床判断是否治愈主要通过以下几点：临床症状全部消失、脑脊液阴性、疗程足够等。
此症经过积极有效的治疗一般愈后良好。不必过于紧张。
指标升高 如果都还是在正常范围里的 也不能说明什么
出院标准一般么就是一个星期不发热 腰穿检查正常
你的孩子之前可能是病毒性脑炎 也有可能是单纯的高热惊厥
现在也无从考究了 不过说实话 病毒性脑炎很凶险 如果不及时治疗的话很危险 会有严重的后遗症 所以医院也不敢怠慢吧
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