不开发票当然可以确认收入，像一些大型的商场，开发票的客户的比例还是不多的，那些企业都申报不开具发票的收入，贵公司为小规模企业，预收100万确认收入为：
1000000/1.03=970873.79元
应缴纳的增值税为：970873.79*0.03=29126.21元。
账务处理：
借：预收账款 1000000
贷：主营业务收入 970873.79
应缴税费--增值税 29126.21
注意：增值税的计算时应该将含税收入换算成不含税收入，公式未：不含税收=含税收入（收到的款项）/（1+税率），增值税=不含税收* 税率。
根据现行的增值税暂行条例，年销售收入超过80万的企业将会被强制申请成为增值税一般纳税人，贵公司要注意税局的责令认定通知书。
1、应缴增值税：100万X0.03=3万。
2、不开票确认收入企业自己申报。
要是你公司的营业额高了 就去申请一般纳税人 这样比较划算
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