A、光合作用的光反应阶段水的光解产生氧气，有氧呼吸的第三阶段氧气和[H]反应生成水，A正确；B、光合作用的光反应阶段水的光解产生[H]与氧气，有氧呼吸的第一、第二阶段产生[H]，故产生[H]的部位有叶绿体基粒、细胞质基质和线粒体，B错误；C、白天绿色植物叶肉细胞中光合作用和细胞呼吸同时进行，黑夜只有细胞呼吸，C错误；D、光合作用光反应阶段产生的ATP只能用于暗反应阶段C3的还原，D错误．故选：A．
