总公司要有自己的一套账，两个分公司也可以有自己的账，这不矛盾。一般情况下，分公司与总公司都不在同一地点，并且要有自己的营业执照，肯定要有自己的账套的，只是分公司的账年末要与总公司报表合并。
看情况。如果2个分公司是独立核算自负盈亏，可以纳税，就必须有自己的帐本，而且帐本与母公司是相互独立的。如果分公司只是办事机构，部门，不具备建帐条件与资格，就不能设帐薄了，如果建帐，就会犯《会计法》和《会计基础工作规范》
可以的，但是期未一定要给总公司的帐务进行核对
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