细胞器在光学显微镜下是看不到的，（除非染色，例如用吡罗红、甲基绿等能够看见RNA、DNA)只能看到细胞壁（植物细胞）、细胞质和细胞核等，如果作质壁分离的实验，还可以看见原生质层（细胞膜、液泡膜和两层膜之间的细胞质）；电子显微镜才能够看见细胞器和细胞膜等；另外电子显微镜还能将像显示于电脑上~~~
光学显微镜的观测原理是通过光子的反射(自然光或者探照光)较宏观电子显微镜的观测原理是通过电子的反射(类似电子枪)较微观
