现在是发展到了柯南基本上能在每一个人面前都毫不保留地展示自己的推理能力而不会遭怀疑的时段，估计离结局不会太远了，在柯南最近几集我发现了一些细节，就是毛利在叙述案件情况时都是弯着腰，望着柯南，似乎是有意要说给柯南听的，由此可见，毛利小五郎已经知道了柯南用麻醉药替他推理的事情了，他是为了让柯南能够尽早破案才这样做的，一个小鬼竟然有如此的推理能力，我估计毛利没有笨得那么厉害，从柯南那诡异的行踪，以及打败基德的次数来看，毛利应该猜得出柯南就是工藤新一。
如果你是看到第十步剧场版（大概是06年10月）
从那之后的主线TV版剧目我来说一下
425集应该看了吧！（没看赶紧看）
之后兰班上转来一个长得像水无的男生叫本堂瑛佑（429 再也回不来的二人登场）之后这几集看上去和黑暗组织的关系不大（实际穿插讲了一些黑暗组织找水无的事）
462 黑暗组织的影子 年幼的目击者 B
463 黑暗组织的影子 奇妙的照明 B
464 黑暗组织的影子 谜样的高额报酬 B
465 黑暗组织的影子 珍珠的流星 B
之后是水无“争夺战”和赤井殉职
491 红与黑的碰撞 开端 B
492 红与黑的碰撞 血缘 B
493 红与黑的碰撞 绝叫 B
494 红与黑的碰撞 冥土 B
495 红与黑的碰撞 昏睡 B
496 红与黑的碰撞 侵入 B
497 红与黑的碰撞 觉醒 B
498 红与黑的碰撞 搅乱 B
499 红与黑的碰撞
500 红与黑的碰撞 遗言 B
501 红与黑的碰撞 嫌疑 B
502 红与黑的碰撞 洁白 B
503 红与黑的碰撞 决死 B
504 红与黑的碰撞 殉职 B
（我的秀呀！）
之后出现了一个叫冲矢昂的研究生，很多人认为他是赤井秀一，也有人觉得他是波本（新出现的组织成员，只在509集中朱迪提过，到底是不是高级人物和是不是赤井还有争议，只知道是个厉害人物）也可能都是。
至于《柯南与鲁邦三世》里面小五郎配合柯南解说，你大概是没看仔细吧！那个小五郎是鲁邦假扮的！！！！！！！！！！！
小五郎没有发现（当然还有小五郎装糊涂的说法，之不是柯南主流所关住的先不说了）要是不明白，给我发百度消息（知道这是什么吧！）
《柯南与鲁邦三世》中最后的毛利是鲁邦变装的。至少在中国发行的漫画书中，毛利还没有知道柯南的真实身份。从柯南与FBL相遇，并与黑衣组织交过手，把水无送回组织，水无又不得不将赤井杀死之后，好像又回到了平常的破案之中。讲到“铁锂”的故事了吧，关于基德的
柯南与鲁邦三世中的小五郎是鲁邦伴的！小五郎不知道柯南是新一，也不知道柯南用麻醉药替他推理；剧场版到13部！名侦探柯南VS黑暗组织！TV到540集（7月18日出541集）！
鲁邦三世那个不用太在意，这都没有算进柯南tv版中
新一的真实身份和麻醉药的事还没被发现
关于主线剧情还是与黑衣组织有关，并没有太大的发展，不过漫画699话讲到赤井秀一（他在500多集时候死了），700话应该会延续主线剧情，应该会有新的发现
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