在PDF中加入书签的方法

一、给PDF添加链接：
　　1、选择菜单“编辑”->“链接”->“矩形链接工具”（我喜欢这个，还有一个选项：四边形链接工具，有兴趣的可以试下）；
　　2、框选需要点击感应的文本位置，弹出“创建链接”窗口，点击下一步；
　　3、弹出“跳至页面”窗口，将页面翻至目标页面位置，然后点击“设置”按钮；
　　4、保存退出，重新PDF文件，就可以通过点击刚才设置的链接直接跳到目标页面位置了。
二、给PDF添加书签：
　　1、点击书签面板（在页面左边）的“点击添加新书签”按钮，输入书签名字，一般都是目录的章节名字；
　　2、将页面位置移动到目标位置，如：书签名字是“第一章 xxx”，那么将页面位置拖到第一章的具体内容处；
　　3、右键点击书签名字，在右键菜单处选择“设置目的位置”。
　　4、补充一：可以通过右键点击书签名字，在右键菜单中选择“添加书签”来添加新的同级书签；还可以通过拖动一个书签到另一个书签那里变成它的子书签，这样就可以建立级别不一样的书签体系了。
　　5、补充二：将整个目录结构映射到书签体系还是比较繁琐的，如果是一个字一个字地打出来，很费时，我是通过这样来做比较方便点：选择菜单“视图”->“文本查看器”，进入文本模式，然后将目录文字内容复制到一个记事本里面，再用excel打开，只选取目录章节的编号和名字，将页码过滤掉，再将表格的第一列内容复制到另一个记事本，然后将记事本的内容一行一行地复制出来，作为书签的名字，这样就不用打那么多字了。我这个方法有点笨，希望其他有经验的朋友提供更便捷的方法。
　　6、补充三：设置书签位置的时候，顺便把文字大小的“缩放”也设置了吧，不然每次翻页都要重新设置页面文字大小，非常烦人，一般的PDF工具都没锁定缩放的功能，真烦躁。

acrobat是一个很全面的修改pdf文件工具，可是正如题主所说，这个软件太大了，而且使用起来也需要很长时间才能够熟练掌握。那么我们就可以通过使用pdf编辑器加你个文件给打开，然后点击选取按钮，选取需要被添加为书签的文字段，然后用鼠标右键点击选取的文字，在弹出的选项中选择新增书签，这样我们就在pdf文件中添加一个新的书签了。

在PDF中加入书签的方法：
方法一：如果你只是想做个标记，方便下次阅读，可以这样设置 文档——辅助工具助手第5步，勾选重新打开文档至上一次打开的页面，点完成，以后再打开同一文档，会自动到你最后阅读的页面 。
方法二：
1、打开编辑的首选项项
2、选中因特网，确保“网络浏览器选型”均选中；
3、制作bookmark_page.js文件：
// bookmark_page.js, ver. 1.0
// visit: www.pdfhacks.com/bookmark_page/
// edit:cjs 2008-02-17
// 1 修改为中文标签
// 2 设置书签时可以自动获取当前的书名
// 3 自动获取当前所在的页码与总页数,方便查阅
// 4 实现更多功能可以参看Adobe Reader的SDK
4 将文件拷贝到C:\Program Files\Adobe\Reader 8.0\Reader\Javascripts目录下
5 重新打开Adobe Reader,查看“视图”菜单的最下面，可以看到可以管理书签了。
书签 用作题写书名的，一般贴在古籍封皮左上角的，有时还有册次和题写人姓名及标记阅读到什么地方，记录阅读进度而夹在书里的小薄片儿 ,随着网络时代的发展，又衍生出电子书签等，以记录阅读进度和心得。

foxit reader可以添加书签。

看这里的介绍吧 有图有真相 很好用的http://hi.baidu.com/hcq11/blog/item/a1a3852a2434489c033bf6f2.html
要不然就用Foxit reader好了 一个小巧的pdf阅读器 它里面有加书签的功能