增值税申报表附表二第25栏次“期末已认证相符但未申报抵扣”包括：1、商贸企业辅导期一般纳税人已认证相符但未收到总局下发比对结果而尚未抵扣的进项税额；2、已认证但按税法规定不能抵扣的进项税额（如购入固定资产......).
商贸企业辅导期一般纳税人进项税额当期认证后不能抵扣,要等到比对结果出来后(没有问题)才能抵扣，辅导期一般纳税人当月应抵扣税额应是当期收到总局下发比对结果无误专用发票上注明的进项税额他等于期初已认证相符但未申报抵扣额+本月已认证相符但未申报抵扣额-期末已认证相符但未申报抵扣额。
非辅导期一般纳税人增值税申报表主表中的进行税额（可能是12行）要等于附表二本期认证相符且本期申报抵扣额（可能是第二行）相等；辅导期一般纳税人增值税申报表主表中的进行税额要等于附表二前期认证相符本期申报抵扣额（可能是第三行）相等。
期初已认证相符但未申报抵扣+本期认证相符且本期未申报抵扣=期末已认证相符但未申报抵扣
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