公司这样处理是合理不合法。应将假发票退回换成真发票，由假发票给公司造成的损失应由你不本人负责。可以和公司交涉此事，争取合法权益。
至于收了两次假发票的事件，无法判定是故意的还是非故意的，这就取决于你的态度了。好好跟公司商量，总会有解决办法的。
公司查出你的报销单据中有假发票,只能按公司制度将这两张假发票进行处理.不能因为这样将你5个月的报销给扣了,是严重的不合法,就算是公司有制度写明都是不合法.你可以先与公司交涉,如果不行就将事件以书面形式交当地劳动部门处理!
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