根据异常的时间周期进行缴纳罚款和滞纳金，然后补申报。税款入国库，到税务机关解除异常。一般到税务解除异常，带着公章，执照（三证或五证合一的）副本原件及复印件，经办人身份证原件及复印件，补申报的表格即可。
若未清缴，可通过申报表作废功能作废原有申报，再进行重新申报;若已清缴，纳税人可通过申报错误更正功能进行更正。申报错误更正后，系统会自动根据前后申报信息判断应补退金额：
一是应补退金额为正，系统会自动产生应补差额税款，纳税人在缴款期限内通过缴款功能补交税款即可，但如果超过缴款期限，则需要到大厅缴款;
二是应补退金额为负，即出现多缴税款情况，则请纳税人到主管税务机关申请办理退抵税流程;
三是应补退金额为零，则系统自动进行应征数据调整，纳税人不需补交税款或办理退抵税流程。
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