植物基因工程:主要是育种,培育抗性、高产的新品种。动物基因工程:提升畜禽的生长速度、改良品质;利用转基因动物生产特种蛋白因子;动物基因工程器官可以用于拯救生命;转基因动物模型可以用于基础研究、疾病机理研究、筛选药物等。细菌基因工程:合成化学方法难以合成的药物;用环境微生物治理环境;改良食品、饲料及其他工业生产菌的性能;基因工程菌还辅助农业,使少病虫害等。病毒基因工程:研制基因工程病毒疫苗;用作杀虫剂;用作载体用于基因治疗。医药基因工程:疫苗、抗体、核酸类药物、基因治疗。