A、可遗传变异能为生物进化提供原材料，不遗传变异不能为生物进化提供原材料，自然选择决定进化的方向，A错误；
B、染色体的缺失或增加，会使染色体上基因的数目发生改变，染色体的移接或颠倒会使染色体上基因的排列顺序发生改变，B正确；
C、突变能产生新的基因，因而能使种群的基因频率发生改变，导致种群发生进化；但基因重组不产生新的基因，不一定使种群的基因频率发生改变，C错误；
D、马和驴杂交产生了骡子，但骡子高度不育，不能称为新的物种，D错误．
故选：B．
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