最安全的备份方法是将他们纪录於不同的媒体中，例如磁带，抽取式硬碟，可写式 cd .等。 进行一般的备份应该是负责任的系统管理者的最高优先考虑。虽然Linux是一个高度可靠的作业系统，系统失效仍然可能发生。可能因为硬体故障，电源中断，或其他不可预料的问题。更常见的这些问题是来自人为的错误，不当的变动，甚至因为删除重要的档案。如果您负责管理系统上的用户，一定可能常被要求重建因为不小心误删的档案。 如果您进行一般备份，以每日为基础较好（至少对更动频繁的使用者档案），您将会有助於减少档案的损失，并且增加复原程度。最安全的备份方法是将他们纪录於不同的媒体中，例如磁带，抽取式硬碟，可写式cd.等。然後将您的备份和您的Linux系统分开存放。有时候这可能并不实际——也许在您可以存放备份磁带的地方没有防火室！或是在第一优先的地点没有办法存取这样的外部备份系统。虽然如此，仍然可以进行备份，只是会受到一点限制。服务器备份程序进行Linux备份有几种不同的方法，其中包括所有Linux发行版本中都有的命令列工具，例如“dd”，“dump”，“cpio”以及“tar”。其他还有文字型态工具，例如“Amanda”及“Taper”，这些是被设计来在备份及回存过程中加入更友善的使用者介面。当然也有图形介面的工具，像是“KDat”。最後，还有商业化的备份工具，像是“BRU”和“PerfectBackup+”。这些备份计划中任何之一都足以提供您宝贵资料的保护。 这里有一些包括哪里可以获得工具的列表，可以在“LinuxApplicationsandUtilitiesPage”找到，当决定好备份方式，您可能要考虑下列几点因素： 可携性-备份的可携性（亦即。从一个Linux发行版本或应用Unix备份然後回存到另外一个；例如从Solaris到RedHatLinux）对您而言是否重要？如果是，可能想要选择一个命令列的工具（亦即。“dd”，“dump”，“cpio”，或“tar”），因为您可以相当地确定该工具可以在另一个*nix系统上找到。 无人或自动备份-定期自动进行备份而不需人力介入之能力，对您而言是否重要？如果是，您可能需要能支援该方案的工具及备份媒体。 使用者友善-使用者友善的介面对您而言是否重要？如果是，您可能想要选择一个文字或图形介面的工具。商业的应用程式可以提供最简便的介面及技术支援。 远端备份-从远端机器进行备份及回存的能力对您而言是否重要？如果是，您可能想要选择命令列或文字模式的工具而不是图形介面（除非您有相当快的网络连结及执行远端Xsessions的能力）。 网络备份-从网络主机进行备份及回存对您而言是否重要？如果是，您可能要用一些支援从网络存取备份设备的命令列工具（像是“tar”），或是专用工具程式例如“Amanda”或是一些商业工具程式。 媒体型态-备份可以储存在很多不同的媒体，像是磁带，外接式硬碟，ZIP磁碟，或可读写CD.考虑售价及可靠性，储存容量，及传送速度。 警告：当备份您的系统时，不要包括“/proc”伪档案系统！/proc中的档案并非真的档案，而仅是看起来像档案的描述，而且指向核心资料结构的连结。备份“/proc/kcore”，这事实上这是一个伪装档案，包含记忆体中所有的资料，会浪费很多的磁带！您可能也需要避免备份“/mnt”档案系统，除非您有从CD-ROM，软碟机，网络分享档案，或其他安装设备上备份的特殊需求。 明显地，备份及回存的过程会因您所选择的备份方法而有所不同。
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