可以从以下几方面进行：
1、借款协议的有效性分析，主体、内容是否合法；
2、协议履行情况审查，有无付款凭证；
3、违约责任的分析，本金及利息的数额；
4、合同责任主体分析，是否需要揭开法人面纱向法定代表人追偿，或是向A公司追偿；
5、律师建议：法院诉讼或申请破产，或对A公司进行资产调查之后再采取相应对策。
具体这个问题可以从以下几个方面写：
1、法律关系分析：借贷关系的主体的适格性及借贷行为的效力，
2、公司法人代表、股东与公司之间的关系：独立性及责任的有限性，是否存在需承担连带责任的情形。
3、解决办法：诉讼（虚假/抽逃出资时的诉讼和一般借贷关系诉讼）、申请破产等。
大致是这样。
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