主要是讲: 俄罗曼诺夫王朝的皇室秘宝——复活节之卵,将在大阪铃木财团美术馆内展出的同时,怪盗基德寄出犯案预告信准备夺取这无价的皇家艺术之宝,于是铃木会长要求小五郎协助警方侦查,以防彩蛋被窃取。柯南一行人来到大阪,遇到服部平次,便一同侦查此案。在美术馆遇到了俄罗斯大使馆的书记、珠宝美术商、罗马王朝研究家、职业摄影师等人。看完彩蛋,大家便解读预告信线索,不料将时间、地点都解读错误。而基德窃听到彩蛋被转移了,在疏于防备的情况下,基德成功地找到了回忆彩蛋。然而基德在逃离途中,却被神秘的杀手狙击,坠海失踪,生死不明。柯南以新型滑板追踪,夺回彩蛋。与此同时从国外回来的香阪夏美小姐,从祖母的遗物中发现彩蛋的原稿图与实物不同。 柯南看了原稿后,认为彩蛋有两颗,而在彩蛋的玻璃上映照出夏美曾祖父所盖的城堡,所以大伙儿及对彩蛋虎视眈眈的研究者决议要去此城探索,找寻第二颗彩蛋。在返回东京的船上,摄影师寒川被杀,而且和基德相同是被击中右眼。目暮带着白鸟赶到,调查后柯南发现凶手可能是专门狙击右眼的职业杀手“史考兵”。而白鸟却几次揭穿柯南的提示,使小兰对柯南的身份起了怀疑……
这部无论是从故事情节上还是从场景设置上都恢复了第一部所具有的那种高水准,主要内容是围绕着一颗罗曼诺夫王朝的皇室秘宝被称为「记忆彩蛋」的回忆之卵而展开的。它意外地在日本被发现了!罗曼诺夫王朝的皇室密宝就在铃木财团展出的同时,柯南最强的对手--“怪盗基德”再次登场,发出预告函,宣布将在众目睽睽下,夺取这无价的艺术瑰宝。柯南、小五郎、平次、兰一行人,受邀解读预告函线索,不料发生致命错误!基德成功偷走“回忆之卵”后,途中却遭神秘杀手狙击,坠海失踪。柯南以新型滑板追踪,惊险夺回“回忆之卵”,才发现它的外观与设计图上完全不同,这究竟是怎么回事?
而小兰也开始怀疑柯南与新一的关系,名侦探——江户川柯南,终于要面对他生平最大的危机,同时,也是史上最难解的谜团!在制作此剧时,工作人员为了贯彻柯南系列所特有的那种写实场景风格,拍摄了大量的实景照片,取景地点从大阪到横须贺,范围大到豪华客轮小到民宿民宅,连步美所住的那栋豪华住宅,就是取景于青山刚昌本人所居住的高级住宅楼(再一次感叹,日本的漫画家真的都非常非常的有大钞!)。本片中的登场人物非常之多,几乎柯南系列中的所有人物都出现了,尤其是怪盗KID常常变装,在众人的眼皮下以多种形象出现,但因为故事情节的巧妙编排,所以看起来并无杂乱无章之感,反而显得更加的跌宕起伏,曲折动人。
讲的是新一和基德的对绝