长期避孕药会扰乱体内的激素，造成周期混乱是大有可能的，建议改用其他的避孕方式，避孕套避孕环这类的，对自己的伤害小些，其实男人的精液对女人来说也是外来物质，即使避孕了对身体也有不好的影响，最好使用避孕套，这样能预防很多疾病。
月经不干净是你卵巢功能低下，你自己的月经周期不好，所以医生让你吃避孕药造人工周期。人工周期有效率挺高的，不过你觉得对生活影响不大可以考虑其他治疗，如中医药调理，效果不错的
