护照不需要扣留，入管局收到你的签证更新材料后会在你的护照上盖一个签证受理章，即使旧的签证有效期已过，你也能在日本合法滞留。至于在更新期间能不能回国，要看你的签证是否到期，如果在你旧的签证有效期内你是可以回国的，只要你在签证过期前回日本即可。
好消息，不扣留，会给你卡个戳。坏消息，即使不扣留，你也不能回国。因为你的签证在审查，理论上不一定给你签证，所以这期间是不可以回国的。回国会被拒绝入境的 。三楼说的不对，签证到期前两三个月，再入境，就会被拒绝入境。你可以打听一下身边的人
更新期间可以回国阿... 我的签证就是大前天给入国管理局了. 但是要等到发下来的话就得到8月10几号了. 可是我的机票是1号的. 所以我就说明了一下情况.人家就给护照上面弄了一个纸条 说是更新中. 不过这样貌似对更新签证有点不太好. 还有就是我的签证是定住者~
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