全日本很有名的高中生侦探工藤新一，被称为“关东的名侦探”。但是因为目击黑暗组织（后 称组织）的交易被发现而遭毒手，被灌下APTX4869（组织研发的药物）后导致身体缩小，以“江户川柯南”的身份寄住在小兰的父亲毛利小五郎的家中暗中调查组织的活动，本想用毛利小五郎来找出使自己缩小的黑暗组织，可是没有想到，毛利小五郎的智商很低，而且还好酒、好色，一旦有案子发生，却解决不出来，于是，缩小后的新一实在看不下去了，就从阿笠博士那里拿来了蝴蝶结变音器和手表型麻醉枪，来帮助毛利小五郎解决案子，让毛利小五郎有了“沉睡的毛利小五郎”之称。
在身体缩小之前，侦探名声响誉全日本，帮助警方解决过很多棘手的案件，曾被誉为：“高中生名侦探”、“平成年代的福尔摩斯”、“日本警察的救世主”、“关东的工藤”、“90年代的夏洛克�6�1福尔摩斯”。 目暮警官更是对他信任有加。
而他能有今天的成就，多归功于从小受到侦探小说家的父亲的影响，家中的侦探类藏书的数目就很可观，所以从小就喜欢玩侦探破案的游戏和看推理小说，有了丰富的推理知识，而且是个铁杆福尔摩斯迷。母亲是原著名女演员——藤峰有希子（嫁给新一的父亲后改名为“工藤有希子”）这也为新一变小后能成功的伪装，并不被识破提供了有利的学习条件。
即使被大家看作是名侦探，但本质还只是个高中生。就读于帝丹高中二年级B班。除了推理，也是个和普通人一样的热血少年，尤其是热爱足球，国中时参加过足球社。既然是普通的高中生，自然也有喜欢的女生，那就是青梅竹马的毛利兰。
这也是部分柯南迷关注的热点。虽然很喜欢毛利兰，但由于天生在感情方面的迟钝而迟迟没有向对方告白，其实在柯南剧场版中的瞳孔中的暗杀者中，新一在小兰失忆的时候对小兰说过我喜欢你，但是，新一还没有给小兰一个正式的告白。 父亲：工藤优作(Yusaku kudo)
他是工藤新一的父亲，39岁（推测），推理能力超强（比新一还厉害），首屈一指的推理小说家，目前仍然在连载中的人气作品是《暗之男爵（night baron）》，在美国十分受欢迎，荣登排行榜宝座。讲的是一个戴著恐怖面具，一身黑色礼服的怪人，经常在晚上作案，手段高明，神出鬼没。他是目暮警官遇到瓶颈时谘询的对象。20年前在米花观景餐厅餐厅向有希子求婚（详见《危命的复活》系列）。他和妻子长年在国外生活，可是新一不愿意住到国外去（是因为小兰，详见《043江户川柯南诱拐事件》）。
母亲：工藤有希子(Yukiko kudo)
本名藤峰有希子，37岁。工藤新一的母亲，工藤优作的妻子。嫁给优作之前是出名的女优，19岁便囊括了各类奖项，风靡全球，可是个大美人噢。 20岁时与优作恋爱结婚，退出演艺圈，与优作一起在美国洛杉矶生活，两人感情时好时坏，时常与老公优作吵架，但其实心里还是深爱著他！曾经因为吵架而独自一人返回东京，把柯南吓了一跳，最后还是和优作回美国去了。
邻居兼最亲密的朋友：阿笠博士(Agasa Hakase)
发明家，52岁。住在新一家隔壁的22番地，自称是天才发明家，爱好做各种各样发明的，常因为实验失败而引起爆炸，但是也做出过非常了不起的东西。新一变小后只把自己的真实身份告诉了他，是第一个知道新一缩小的人。柯南从他那里得到许多帮助，特别是那些为柯南设计的很好用的工具。他是优作与有希子的老朋友， 新一可靠的精神支柱，时常提供新一许多资讯。碰巧的是宫野志保（灰原哀）变小后倒在新一家门口也是被他发现的，一起想出了“灰原哀”这个名字，且让她寄住在家里。之后好心的博士收留了她（不过博士的电脑因此而倒了霉）。买了一台金甲虫车，常常载少年侦探团出去游。
青梅竹马兼女友及妻子候选：毛利兰(Ran mouri)
小兰是故事里的女主角，新一的青梅竹马，帝丹高中2年级生，和新一是同班同学，血型和新一相同，对他有着超越一般朋友的感情但又不愿承认，心中其实早已认定了非新一不嫁的概念（看，这一对多配呀）。好友为园子及和叶，坚强又温柔的女孩，擅长料理家事，喜欢追求流行、偶像，常与园子去唱卡拉ok。 因崇拜空手道冠军前田聪，便开始学习空手道且对空手道有著浓厚的兴趣，工夫也不浅，为空手道社的主将，还曾经获得东京空手道大会的冠军。所以她一生气柯南就很怕。 不过她最怕的东西是妖魔鬼怪，明明有实力打倒袭击她的凶手，可是却被吓得动弹不得。她曾经多次怀疑过柯南和新一是同一个人，但是阴差阳错的被柯南瞒过去了（有时是有人帮忙的）。希望分居的父母能和好和新一赶快回来！但其实小小新一就在身边……
阿姨（未来丈母娘）：妃英理(Eri kisaki)
小兰的母亲，是个有名的律师，开了一家“妃法律事务所”。因受不了小五郎的种种不良嗜好，所以目前处於分居状态（其实导致他们俩分居的最大原因还是因为英理烧的饭菜超级难吃）。（详见剧场版2《第十四个目标》）。与小兰的感情很好，经常联络。有精密的分析头脑，比小五郎能干许多。因为新一和小兰小时候出去探险而被她骂，故新一便不由得对她产生一种恐惧感。新一小时候去小兰家玩时也曾经不幸，吃了她“非常美味”的料理。她对小五郎有着深深的爱。
叔叔：毛利小五郎(Kogoro mouri)
小兰的父亲，职业是侦探，推理能力奇差，自行推理出的案件约不到十件，大多都由柯南的暗示才得以破解。所以每回柯南都把他麻醉后再用他的声音揭破案件的真相，所以大家送这位毛利侦探一个“沉睡的小五郎”的名号。他原来是一名优秀的警局刑警，和目暮十三是同事，后来因为一起事件而辞职（详见剧场版2《瞳孔中的暗杀者》），改行当私人侦探，在自家二楼开“毛利侦探事务所”，三楼为居住地。 毛利小五郎的枪法十分准，柔道也是一流的，大学时代是柔道社的，被主将认为是社里最有实力的人（小兰的空手道才能也有他的遗传因素吧）。小五郎一见漂亮女性就眼睛发直，最喜欢的偶像是歌星冲野洋子小姐。另外他的吃相非常不好，没事喜欢去打麻将，或是喝啤酒，但是经常喝醉。总之他没有一点名人的风度，老婆妃英理因此受不了他，于是在十年前就与他分居。但是一旦认真起来也非常厉害，对妻子妃英理有着不善表达的爱。
同班同学：铃木园子(Sonoko suzuki)
帝丹高中2年级生，小兰的同班同学和好友，铃木财团董事长－铃木史郎的次千金，姐姐菱子为研究生，家里十分有钱，时常举行宴会、举办活动。看到周围的女孩都有男朋友很羡慕，成天想着怎么钓个帅哥。时常与小兰去唱卡拉ok。梦中情人是怪盗kid。与杯户高中空手道高手－－京极真，两情相悦。有时小五郎不在场，柯南就借助她做案件推理，但醒来后还洋洋得意。 但是与小兰的友谊真挚，从不摆富家女架子。
最亲密的敌人：怪盗基德(Kaito kid)
专门以艺术品为目标的超级盗窃犯，国际罪犯代码为“1412”。喜欢在晚上作案，身著白色礼服，戴著特制的单眼镜，背后的披风可以变为滑翔翼，善于各种魔术手法，精通易容，更能够不借助道具而模仿任何人的声音，打听好他人底细后，经常可以完美的装扮成别人，神出鬼没地盗取预告的目标，玩弄警察于掌中。世人称他为“月光下的魔术师”、“平成的亚森．罗宾”。通常偷得的宝石、书画等，不是丢弃便是归还失主。劲敌原为伦敦转学侦探－－白马探，但第一个揭穿他完美易容术的是柯南，于是此后两人成了夙敌。与新一第一次交手在盗取钟塔的指针事件。Kid的真身黑羽快斗是东京的高二学生，他是为了找出杀父的秘密组织，因此继承父亲做怪盗kid。喜欢的人是既是同学也是青梅竹马的中森青子。
最亲切的挚友：服部平次(Heiji hattori)
大阪人，有着浓厚的关西腔。大阪警察局局长服部平藏的儿子，与新一齐名的关西的高中生名侦探。喜欢的推理作家为埃拉里．昆恩。因为人们经常把他们做比较，说什么“关东的工藤，关西的服部”，所以服部平次把新一当作劲敌，一直想找新一比试一下。因为新一变成了柯南，所以他当然找不到新一本人。在之后的案件推理中，还是柯南技高一筹，但是平次也注意到柯南的可疑迹象，最终识破了他的真身。以后他们就成了好友，经常联手出击，两人之间似乎有深厚的友谊。可是平次每次看到柯南都“工藤”“工藤”的乱叫，引起小兰的怀疑，还好平次人都能够掩饰过去，即使这样柯南还是每次都会吓个半死。最高兴的事是和新一的推理意见有分歧的时候。他经常带著青梅竹马——和叶做的手铐碎片的护身符在身上，每次有大事发生时，总是能救他一命，似乎很灵验喔！
最默契的搭档：灰原哀（Haibara Ai ）
灰原哀原名宫野志保（日英混血）（Shiho Miyano），组织代号雪莉（sherry），父亲宫野厚司（日本人）（Atsushi Miyano），母亲艾莲娜宫野（英国人）（Irene Miyano），还有一位聚少离多的姐姐——宫野明美（Agemi Miyano）。因父母均为黑衣组织成员，所以两人也成为组织成员。志保在黑衣组织中为少数头脑顶尖人物，与其父一样是个科学狂人，故受命开发制造毒药。但与此同时，父亲因车祸死亡，而母亲却在此事中下落不明。姐姐的男友赤井秀一为FBI成员，但因希望脱离组织而被琴酒（Gin）杀害。志保因此背叛组织，在等待组织的处分前吞下了自制的APTX4869而变小，成功地从被关押的毒气室的垃圾道逃出。逃离组织后，走投无路的志保只能去找工藤新一。却因饥饿寒冷在新一家门前晕倒，被好心的阿笠博士收留，就读于柯南所在的帝丹小学1年级B班，化名为灰原哀。
他爸是世界闻名的推理小说家，喜欢看《福尔摩斯》。他妈在结婚以前是著名的女演员。新一是一个高中生侦探，帮助警方破过许多案子。青梅竹马是毛利拉兰。
父亲工藤优作是世界级推理小说家，母亲是著名演员工藤有希子，父母在联合国有人脉
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